ABSTRACT
Introducción. El tacrolimus es un medicamento inmunosupresor ampliamente usado en trasplante hepático, que presenta una gran variabilidad interindividual la cual se considera asociada a la frecuencia de polimorfismos de CYP3A5 y MDR-1. El objetivo de este estudio fue evaluar la frecuencia de los polimorfismos rs776746, rs2032582 y rs1045642 y su asociación con rechazo clínico y toxicidad farmacológica. Métodos. Se incluyeron pacientes inmunosuprimidos con tacrolimus a quienes se les realizó trasplante hepático en el Hospital San Vicente Fundación Rionegro entre 2020 y 2022, con supervivencia mayor a un mes. Se evaluaron las variables clínicas, rechazo agudo y toxicidad farmacológica. Se secuenciaron los genes de estudio mediante PCR, comparando la expresión o no en cada uno de los pacientes. Resultados. Se identificaron 17 pacientes. El 43 % de los pacientes se clasificaron como CYP3A5*1/*1 y CYP3A5*1/*3, entre los cuales se encontró asociación con aumento en la tasa de rechazo agudo clínico, al comparar con los pacientes no expresivos (100 % vs. 44 %, p=0,05); no hubo diferencias en cuanto a la toxicidad farmacológica u otros desenlaces. Se encontró el polimorfismo rs2032582 en un 50 % y el rs1045642 en un 23,5 % de los pacientes, sin embargo, no se identificó asociación con rechazo u otros eventos clínicos. Conclusiones. Se encontró una asociación entre el genotipo CYP3A5*1/*1 y CYP3A5*1/*3 y la tasa de rechazo clínico. Sin embargo, se requiere una muestra más amplia para validar estos datos y plantear modelos de medicina personalizada.
Introduction. Tacrolimus is an immunosuppressive drug widely used in liver transplantation, which presents great interindividual variability which is considered associated with the frequency of CYP3A5 and MDR-1 polymorphisms. The objective of this study was to evaluate the frequency of the rs776746, rs2032582 and rs1045642 polymorphisms and their association with clinical rejection and drug toxicity. Methods. Immunosuppressed patients with tacrolimus who underwent a liver transplant at the Hospital San Vicente Fundación Rionegro between 2020 and 2022 were included, with survival of more than one month. Clinical variables, acute rejection and pharmacological toxicity were evaluated. The study genes were sequenced by PCR, comparing their expression or not in each of the patients. Results. Seventeen patients were identified. 43% of the patients were classified as CYP3A5*1/*1 and CYP3A5*1/*3, among which an association was found with increased rates of clinical acute rejection when compared with non-expressive patients (100% vs. 44%, p=0.05). There were no differences in drug toxicity or other outcomes. The rs2032582 polymorphism was found in 50% and rs1045642 in 23.5% of patients; however, no association with rejection or other clinical events was identified. Conclusions. An association was found between the CYP3A5*1/*1 and CYP3A5*1/*3 genotype and the clinical rejection rate. However, a larger sample is required to validate these data and propose models of personalized medicine.
Subject(s)
Humans , Pharmacogenetics , Liver Transplantation , Polymorphism, Single Nucleotide , Organ Transplantation , Tacrolimus , Graft RejectionABSTRACT
Leaf rust, caused by Puccinia triticina, is the most common rust disease of wheat. The fungus is an obligate parasite capable of producing infectious urediniospores. To study the genetic structure of the leaf rust population 20 RAPD primers were evaluated on 15 isolates samples collected in Pakistan. A total of 105 RAPD fragments were amplified with an average of 7 fragments per primer. The number of amplified fragments varied from 1 to 12. GL Decamer L-07 and GL Decamer L-01 amplified the highest number of bands (twelve) and primer GL Decamer A-03 amplified the lowest number of bands i.e one. Results showed that almost all investigated isolates were genetically different that confirms high genetic diversity within the leaf rust population. Rust spores can follow the migration pattern in short and long distances to neighbor areas. Results indicated that the greatest variability was revealed by 74.9% of genetic differentiation within leaf rust populations. These results suggested that each population was not completely identical and high gene flow has occurred among the leaf rust population of different areas. The highest differentiation and genetic distance among the Pakistani leaf rust populations were detected between the leaf rust population in NARC isolate (NARC-4) and AARI-11and the highest similarity was observed between NARC isolates (NARC-4) and (NARC-5). The present study showed the leaf rust population in Pakistan is highly dynamic and variable.
A ferrugem da folha, causada por Puccinia triticina, é a ferrugem mais comum do trigo. O fungo é um parasita obrigatório, capaz de produzir urediniósporos infecciosos. Para estudar a estrutura genética da população de ferrugem da folha, 20 primers RAPD foram avaliados em 15 amostras de isolados coletadas no Paquistão. Um total de 105 fragmentos RAPD foram amplificados com uma média de 7 fragmentos por primer. O número de fragmentos amplificados variou de 1 a 12. GL Decamer L-07 e GL Decamer L-01 amplificaram o maior número de bandas (doze), e o primer GL Decamer A-03 amplificou o menor número de bandas, ou seja, um. Os resultados mostraram que quase todos os isolados investigados eram geneticamente diferentes, o que confirma a alta diversidade genética na população de ferrugem da folha. Os esporos de ferrugem podem seguir o padrão de migração em distâncias curtas e longas para áreas vizinhas. Os resultados indicaram que a maior variabilidade foi revelada por 74,9% da diferenciação genética nas populações de ferrugem. Esses resultados sugeriram que cada população não era completamente idêntica e um alto fluxo gênico ocorreu entre a população de ferrugem da folha de diferentes áreas. A maior diferenciação e distância genética entre as populações de ferrugem da folha do Paquistão foram detectadas entre a população de ferrugem da folha no isolado NARC (NARC-4) e AARI-11 e a maior similaridade foi observada entre os isolados NARC (NARC-4) e (NARC-5). O presente estudo mostrou que a população de ferrugem da folha no Paquistão é altamente dinâmica e variável.
Subject(s)
Triticum/parasitology , Biomarkers , Agricultural Pests , Fungi/genetics , Puccinia/geneticsABSTRACT
SUMMARY: The purpose of this study was to reveal the differences between ACTN3 genotype (RR, RX, XX) and aerobic performance [Yo-Yo IRT1 (m), VO2 max (ml/kg/min)] in professional and regional amateur league soccer players and to reveal which of these parameters was a distinctive factor in these athletes.71 professional soccer players (age: 23.66 ± 4.11 years; body height: 1.79 ± 6.99 m; body weight: 76.02 ± 6.76 kg; body fat: 11.59±3.11 %) and 62 regional amateur soccer players (age: 23.63 ±3.77 years; body height: 1.81 ± 5.77 m; body weight: 76.36 ± 7.53 kg; body fat: 15.60±4.65 %) volunteered for the study. After DNA extraction from buccal epithelial cells via a commercial kit was performed for the genetic background of the athletes, Real-Time PCR was carried out for genotyping. Furthermore, Yo-Yo IRT1 test was performed to determine the aerobic performance of the soccer players. SPSS 23 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA) package program was used for the statistical analysis of the data obtained in the tests. Shapiro-Wilk test for normality and Levene's test for homogeneity of variance were performed. Chi-Square, Independent Sample T Test and One Way ANOVA test were used in the analysis of the parameters. Statistical significance was set as p0.05); however, there was a statistical significance in favor of professional soccer players in terms of aerobic parameters (p<0.05). Consequently, it can be said that aerobic performance is the distinguishing factor, not the ACTN3 gene, in soccer players.
El objetivo de este estudio fue revelar las diferencias entre el genotipo ACTN3 (RR, RX, XX) y el rendimiento aeróbico [Yo-Yo IRT1 (m), VO2 max (ml/kg/min)] en jugadores de fútbol de ligas profesionales y amateurs regionales y determinar cuál de estos parámetros es un factor distintivo en estos deportistas. 71 futbolistas profesionales (edad: 23,66 ±4,11 años; altura corporal: 1,79 ± 6,99 m; peso corporal: 76,02 ± 6,76 kg; grasa corporal: 11,59±3,11 %) y 62 jugadores de fútbol amateur regionales (edad: 23,63 ± 3,77 años; altura corporal: 1,81 ± 5,77 m; peso corporal: 76,36 ± 7,53 kg; grasa corporal: 15,60 ± 4,65 %) se ofrecieron como voluntarios para el estudio. Después de realizar la extracción de ADN de las células epiteliales orales mediante un kit comercial para obtener los antecedentes genéticos de los atletas, se llevó a cabo una PCR en tiempo real para el genotipado. Además, se realizó la prueba Yo-Yo IRT1 para determinar el rendimiento aeróbico de los futbolistas. Para el análisis estadístico de los datos obtenidos en las pruebas se utilizó el programa SPSS 23 (SPSS Inc., Chicago, IL, EE. UU.). Se realizó la prueba de normalidad de Shapiro- Wilk y la prueba de homogeneidad de la varianza de Levene. En el análisis de los parámetros se utilizaron Chi-cuadrado, prueba T para muestra independiente y prueba ANOVA unidireccional. La significancia estadística se estableció en p0,05); sin embargo, hubo significación estadística a favor de los futbolistas profesionales en cuanto a los parámetros aeróbicos (p<0,05). En consecuencia, se puede decir que el rendimiento aeróbico es el factor distintivo, no el gen ACTN3, en los jugadores de fútbol.
Subject(s)
Humans , Male , Adult , Young Adult , Physical Endurance/genetics , Polymorphism, Genetic , Soccer , Actinin/genetics , Oxygen ConsumptionABSTRACT
El folato es un miembro del grupo de la vitamina B y está relacionado con enfermedades crónicas como anemia megaloblástica, enfermedad cardiovascular, cáncer, disfunción cognitiva y riesgo de defectos del tubo neural. La proteína 5,10-metilentetrahidrofolato reductasa (MTHFR) juega un papel clave en el metabolismo del folato mediante la síntesis de nucleótidos y reacciones de metilación. El gen MTHFR se encuentra en el cromosoma 1 (1p36.3), y se han descrito dos alelos comunes, el alelo C677T (termolábil) y el alelo A1298C.El objetivo de este estudio es evaluar la distribución de los polimorfismos genéticos en MTHFR C677T y A1298C en la población venezolana. METODOS: estudio de tipo transversal, descriptivo, experimental y correlacional Las muestras de sangre se colectaron en 314 donantes no emparentados y sanos de la población. Los polimorfismos de un solo nucleótido(SNP) MTHFR 677C>T y 1298A>C se analizaron mediante polimorfismo de longitud de fragmento de restricción de reacción en cadena de polimerasa (PCR-RFLP). El desequilibrio de ligamiento (LD) entre pares de SNP se calculó mediante la prueba X. usando Prism 5 (GraphPad software, Inc). RESULTADOS: Encontramos mayor frecuencia genotípica de heterocigotos para el polimorfismo MTHFR C677T en la población general venezolana, con excepción del grupo caucásico. El polimorfismo MTHFR A1298C en el 70%de la población de estudio es homocigoto de tipo salvaje, encontrándose una baja frecuencia de homocigoto mutado. CONCLUSIONES: Se encontraron diferencias significativas entre grupos étnicos, destacando la importancia del genotipado racial de estos polimorfismos en la población venezolana(AU)
Folate is a member of the vitamin B and it has also been indicated that may be related to chronic diseases such as megaloblastic anemia, cardiovascular disease, cognitive dysfunction and risk of neural tube. Methylenetetrahydro folatereductase (MTHFR) is a key enzyme of folate pathway by nucleotide synthesis and methylation reactions. Several polymorphisms were reported in MTHFR gene but C677Tand A1298 polymorphism are most studied and these have been reported to be risk factor for several diseases/disorders. The present study was designed to determine the frequency of MTHFR polymorphisms in Venezuelan healthy population. METHODS: The blood samples were collected from 314 unrelated and healthy donors from population. Both the MTHFR 677C>T and 1298A>C single nucleotide polymorphisms (SNPs) were analyzed by Polymerase chainreaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Linkage disequilibrium (LD) between pair of SNPs was calculated through the .. test using Prism 5 (GraphPad sftoware, Inc). RESULTS: We find higher genotypic frequency of heterozygotes for the MTHFR C677T polymorphism in the Venezuelan general population, with the exception of the Caucasian group. MTHFR A1298C polymorphism in 70%of the study population is homozygous wild type, finding alow frequency of homozygous mutated. CONCLUSIONS: Significant differences between ethnic groups were found,highlighting the importance of racial genotyping of these polymorphisms in the Venezuelan population(AU)
Subject(s)
Humans , Male , Female , Vitamin B Complex/administration & dosage , Anemia, MegaloblasticABSTRACT
ABSTRACT One of the greatest challenges facing humanity is the development of sustainable strategies to ensure food availability in response to population growth and climate change. One approach that can contribute to increase food security is to close yield gaps and enhancing genetic gain; to such end, what is known as "molecular breeding" plays a fundamental role. Since a crop breeding program is mainly based on the quality of the germplasm, its detailed genetic characterization is mandatory to ensure the efficient use of genetic resources and accelerating development of superior varieties. Deep genotyping is an essential tool for a comprehensive characterization of the germplasm of interest and, fortunately, the technology is now accessible at a reasonable cost. What must be ensured is the correct interpretation of the genotypic information and on that basis develop efficient practical molecular crop breeding strategies that respond to the real needs of the breeding program.
RESUMEN Uno de los mayores desafíos que enfrenta la humanidad es el desarrollo de estrategias sostenibles para asegurar la disponibilidad de alimentos en respuesta al crecimiento de la población y el cambio climático. Un enfoque que puede contribuir a aumentar la seguridad alimentaria es cerrar las brechas de rendimiento y mejorar la ganancia genética; para tal fin, lo que se conoce como "mejoramiento molecular" juega un papel fundamental. Dado que un programa de mejoramiento de cultivos se basa principalmente en la calidad del germoplasma, su caracterización genética detallada es fundamental para garantizar el uso eficiente de los recursos genéticos y acelerar el desarrollo de variedades superiores. La genotipificación profunda es una herramienta esencial para una caracterización integral del germoplasma de interés y, afortunadamente, en la actualidad se puede acceder a la tecnología a un costo razonable. Lo que debe asegurarse es la interpretación correcta de la información genotípica y sobre esa base desarrollar estrategias eficientes y prácticas de mejoramiento molecular de cultivos que respondan a las necesidades reales del programa de mejoramiento.
ABSTRACT
Introducción: La serotonina tiene gran implicación en la regulación del estado emocional y la ejecución de tareas cognitivas, de modo que los genes del transportador de serotonina (5-HTT, SLC6A4) y de los receptores de serotonina (HTR1A, HTR1B, HTR2A) se convierten en candidatos adecuados para estudiar los efectos de estos genes y sus variaciones polimórficas en las características de la depresión. Objetivo: Revisión de reportes de investigación que hayan estudiado los efectos de las variantes de los genes del transportador y de los receptores de serotonina en las diferentes características clínicas de la depresión. Métodos: Se realizó una búsqueda en las bases de datos Scopus, Web of Science y PubMed con las palabras clave "depression", AND "polymorphism". Conclusiones: Según la revisión de 54 artículos, se encontró que el alelo corto del polimorfismo de 5-HTTLPR es el factor de riesgo más reportado en relación con el desarrollo de depresión y su gravedad. Las variantes de los genes estudiados (SLC6A4, HTR1A, HTR1B y HTR2A) pueden generar alteraciones morfológicas de estructuras cerebrales.
Introduction: Serotonin is highly implicated in the regulation of emotional state and the execution of cognitive tasks, so much so that the serotonin transporter genes (5-HTT, SLC6A4) and the serotonin receptor genes (HTR1A, HTR1B, HTR2A) have become the perfect candidates when studying the effects that these genes and their polymorphic variations have on depression characteristics. Objective: A review of research reports that have studied the effects of variations in the serotonin transporter and receptor genes on different clinical features of depression. Methods: A search of the Scopus, Web of Science and PubMed databases was conducted using the keywords ("depression" AND "polymorphism"). Conclusions: According to the review of 54 articles, the short allele of the 5-HTTLPR polymorphism was found to be the most reported risk factor related to the development of depression and its severity. Variations in the genes studied (SLC6A4, HTR1A, HTR2A) can generate morphological alterations of brain structures.
ABSTRACT
Abstract Objective To evaluate the influence of polymorphisms on genes encoding type I collagen and the genetic susceptibility of tendinopathy. Methodology Case-control study involving 242 Brazilian athletes from different sports modalities (55 cases of tendinopathy and 187 controls). The polymorphisms COLIAI (rs1107946) and COLIA2 (rs412777, rs42524, and rs2621215) were analyzed by theTaqMansystem. Odds ratio(OR)withtheir 95% confidence intervals (CIs) were calculated using a nonconditional logistic regression model. Results The mean age was 24.0 ± 5.6 years old and 65.3% were men. Of the 55 cases of tendinopathy, 25.4% had > 1 affected tendon, the most frequent being patellar (56.3%), rotator cuff (30.9%) and elbow or hand flexors (30.9%). Age and amount of time of sports practice were associated with a higher chance of presenting tendinopathy (5 and 8 times, respectively). The frequency of variant alleles in control and case patients, respectively, was: COLIAI rs1107946 24.0 and 29.6%; COLIA2 rs412777 36.1 and 27.8%; rs42524 17.5 and 25.9%; and rs2621215 21.3 and 27.8%. After adjusting for confounding factors (age and years of sports practice), COLIA2 rs42524and rs2621215 polymorphisms were associated with increased risk of tendinopathy (OR = 5.5; 95% CI = 1.2-24.6 and OR = 3.9; IC95% = 1.1-13.5, respectively). The haplotype COLIA2 CGT was associated with low risk for disease development (OR = 0.5; 95%CI = 0.3-0.9). Conclusion Age (≥ 25 years old), time of sports practice (≥ 6years) and polymorphisms in the COLIA2 gene increased the risk of developing tendinopathy.
Resumo Objetivo Avaliar a influência de polimorfismos nos genes que codificam o colágeno tipo I e a suscetibilidade genética da tendinopatia. Metodologia Estudo caso-controle envolvendo 242 atletas brasileiros de diferentes modalidades esportivas (55 casos de tendinopatia e 187 controles). Os polimorfismos COL1A1 (rs1107946) e COL1A2 (rs412777, rs42524 e rs2621215) foram analisados pelo sistema TaqMan. As razões de chance (OR) com seus intervalos de confiança (IC) de 95% foram calculadas usando um modelo de regressão logística não-condicional. Resultados A média de idade foi de 24,0 ± 5,6 anos e 65,3% eram homens. Dos 55 casos de tendinopatia, 25,4% apresentaram mais de um tendão acometido, sendo os maisfrequentesopatelar(56,3%),omanguitorotador(30,9%)eodocotoveloou flexores das mãos (30,9%). A idade e o tempo de prática esportiva foram associados a uma maior chance de apresentar tendinopatia (5 e 8 vezes, respectivamente). A frequência dos alelos variantes nos controles e casos, respectivamente, foi: COL1A1 rs1107946 24,0 e 29,6%; COL1A2 rs412777 36,1 e 27,8%; rs42524 17,5 e 25,9%; e rs2621215 21,3 e 27,8%. Após ajuste pelos fatores de confundimento (idade e anos de práticas esportiva), os polimorfismos COL1A2 rs42524 e rs2621215 foram associados a um risco aumentado de tendinopatia (OR = 5,5; IC95% = 1,2-24,6 e OR = 3,9; IC95% = 1,1-13,5, respectivamente). O haplótipo COL1A2 CGT foi associado a um baixo risco para desenvolvimento da doença (OR = 0,5; IC95% = 0,3-0,9). Conclusão Aidade (> 25 anos), o tempo de prática esportiva (> 6 anos) e polimorfismos no gene COL1A2 aumentaram o risco de desenvolvimento da tendino-patia.
Subject(s)
Humans , Male , Female , Polymorphism, Genetic , Collagen Type I , Tendinopathy , AthletesABSTRACT
Single nucleotide polymorphisms (SNPs, rs12979860 e rs8099917) in the Interferon Lambda 4 gene (IFNL4, formerly IFNL3and/or IL28B) has been associated with failure in the innate immune response, sustained virological response in hepatitis C, and HTLV-1-associated myelopathy (HAM) development. To search for these polymorphisms several methodologies can be employed, such as sequencing, real-time or quantitative polymerase chain reaction (qPCR), restriction fragment length polymorphism analysis in PCR products (PCR-RFLP), and tetra-primer PCR. The present study compared the performance of the tetra-primer PCR in relation to the PCR-RFLP, both optimized in the Research HTLV Laboratory of the Center of Immunology of Instituto Adolfo Lutz in São Paulo. One hundred DNA samples obtained from patients of STD/Aids Reference Centre in São Paulo, previously analyzed for IL28B SNPs by PCR-RFLP were selected for analysis, after confirming that they represent all IL28B SNPs patterns described in the literature. The results obtained showed concordance between the PCR-RFLP and the tetra-primer PCR SNPs results, and because of the low cost, easy to perform, and minor employment of biological specimen and reagents, the tetra-primer PCR is of choice to be used in routine. (AU)
Polimorfismos de nucleotídeos únicos (single nucleotide polymorphisms, SNPs rs12979860 e rs8099917) no gene que codifica o Interferon Lambda 4 (IFNL4, antigamente IFNL3 e/ou IL28B) têm sido associados às falhas na resposta imune inata e resposta virológica sustentada na hepatite C, e a mielopatia associada ao HTLV-1 (HTLV-1-associated myelopathy, HAM). A pesquisa destes polimorfismos pode empregar diversas metodologias: sequenciamento, reação em cadeia da polimerase em tempo real ou quantitativa (quantitative polymerase chain reaction, qPCR), análise de fragmentos de restrição enzimática em produtos de PCR (restriction fragment length polymorphism in PCR products, PCR-RFLP) e a tetra-primer PCR. Este estudo comparou o desempenho da tetra-primer PCR em relação a PCR-RFLP, ambas otimizadas no Laboratório de Pesquisa em HTLV do Centro de Imunologia do Instituto Adolfo Lutz de São Paulo. Foram selecionadas 100 amostras de DNA obtidas de pacientes do Centro de Referência e Treinamento em DST/Aids de São Paulo cujos SNPs na IL28B foram anteriormente determinados por PCR-RFLP e representaram todos os perfis descritos em literatura. Os resultados obtidos mostraram concordância entre elas, e pelo fato da tetra-primer PCR ter menor custo, ser de fácil execução, empregar menos tempo, insumos e material biológico, é a técnica de escolha para uso em rotina. (AU)
Subject(s)
Polymorphism, Restriction Fragment Length , Polymerase Chain Reaction , Interleukins , Polymorphism, Single Nucleotide , Interferon LambdaABSTRACT
La diabetes mellitus tipo 2 (DM2) es una de las patologías con más prevalencia a nivel mundial, se estima que alrededor de 425 millones de habitantes viven actualmente con DM2 según la OMS, la importancia de realizar pruebas moleculares que permitan realizar un diagnóstico temprano conlleva el análisis de varios grupos de genes implicados en el fenotipo diabético con una marcada resistencia a la insulina y en la mayoría de los casos obesidad, entre los cuales están el polimorfismo de CAG(n) en el ATXN2 gen encontrado en el cromosoma 12q24. Objetivo. Conocer el estado actual del gen ATXN2 en relación al número variable de repeticiones en tándem (VNTR) del trinucleótido CAG(n) y su posible asociación con el desarrollo de la diabetes mellitus tipo 2. Metodología. Se llevó a cabo una revisión sistemática mediante la búsqueda de información en las bases de datos de PubMed, Google Scholar y Elsevier. Para ello, se combinaron palabras clave relevantes, como "diabetes mellitus tipo 2", "polimorfismo CAG" y "ATXN2 gen", junto con "Epigenética de la DM2". Se seleccionaron artículos originales y estudios experimentales publicados en revistas de alto impacto utilizando Scimago Journal Ranks para garantizar la calidad de la literatura revisada. Conclusión. Se determinó la relación entre el ATXN2 y el VNTR CAG(n) y la actividad transcripcional del gen en la DM2 y otras patologías neurodegenerativas es evidente. Sin embargo, para profundizar en este tema, es necesario ampliar el campo de estudio en Ecuador y en otros países latinoamericanos, a fin de analizar la variabilidad genética y su posible relación con la DM2 en esta población.
Diabetes mellitus type 2 (DM2) is one of the most prevalent pathologies worldwide, it is estimated that about 425 million inhabitants currently live with DM2 according to WHO, the importance of molecular tests that allow early diagnosis involves the analysis of several groups of genes involved in the diabetic phenotype with marked insulin resistance and in most cases obesity, among which are the CAG(n) polymorphism in the ATXN2 gene found on chromosome 12q24. Objective. To know the current status of the ATXN2 gene in relation to the variable number of tandem repeats (VNTR) of the CAG(n) trinucleotide and its possible association with the development of type 2 diabetes mellitus. Methodology. A systematic review was carried out by searching for information in PubMed, Google Scholar and Elsevier databases. For this purpose, relevant keywords, such as "type 2 diabetes mellitus", "CAG polymorphism" and "ATXN2 gene" were combined with "Epigenetics of DM2". Original articles and experimental studies published in high impact journals were selected using Scimago Journal Ranks to ensure the quality of the reviewed literature. Conclusion. The relationship between ATXN2 and VNTR CAG(n) was determined and the transcriptional activity of the gene in DM2 and other neurodegenerative pathologies is evident. However, in order to go deeper into this topic, it is necessary to expand the field of study in Ecuador and in other Latin American countries, in order to analyze the genetic variability and its possible relationship with DM2 in this population.
La diabetes mellitus tipo 2 (DM2) es una de las patologías con más prevalencia a nivel mundial, se estima que alrededor de 425 millones de habitantes viven actualmente con DM2 según la OMS, la importancia de realizar pruebas moleculares que permitan realizar un diagnóstico temprano conlleva el análisis de varios grupos de genes implicados en el fenotipo diabético con una marcada resistencia a la insulina y en la mayoría de los casos obesidad, entre los cuales están el polimorfismo de CAG(n) en el ATXN2 gen encontrado en el cromosoma 12q24. Objetivo. Conocer el estado actual del gen ATXN2 en relación al número variable de repeticiones en tándem (VNTR) del trinucleótido CAG(n) y su posible asociación con el desarrollo de la diabetes mellitus tipo 2. Metodología. Se llevó a cabo una revisión sistemática mediante la búsqueda de información en las bases de datos de PubMed, Google Scholar y Elsevier. Para ello, se combinaron palabras clave relevantes, como "diabetes mellitus tipo 2", "polimorfismo CAG" y "ATXN2 gen", junto con "Epigenética de la DM2". Se seleccionaron artículos originales y estudios experimentales publicados en revistas de alto impacto utilizando Scimago Journal Ranks para garantizar la calidad de la literatura revisada. Conclusión. Se determinó la relación entre el ATXN2 y el VNTR CAG(n) y la actividad transcripcional del gen en la DM2 y otras patologías neurodegenerativas es evidente. Sin embargo, para profundizar en este tema, es necesario ampliar el campo de estudio en Ecuador y en otros países latinoamericanos, a fin de analizar la variabilidad genética y su posible relación con la DM2 en esta población.
ABSTRACT
Introduction: Vitamin D and vitamin D receptor (VDR) polymorphisms are associated with autoimmune diseases including systemic lupus erythematosus (SLE). The aim of this study is to assess the genetic association between VDR polymorphisms: TaqI, ApaI, Bsml and FokI and SLE with serum levels of Vitamin D in the Colombian Caribbean population. Method: Case and control study. One hundred and thirty-three patients with SLE and 100 healthy individuals were included. VDR polymorphism were genotyped by RT-PCR and Taqman® probes. Allelic, genotypic and haplotype associations were estimated. Serum vitamin D concentrations were quantified by Elisa. Values of 30 to 100ng/ml were established as a normal reference range. P values <.05 were considered statistically significant. Results: A high prevalence of SLE was observed in women (94%) and was associated with a higher risk of SLE [OR: 10.8; 95% CI: 4.7-24.6] (p<.05). Moreover, higher risk of SLE was observed in individuals with FokI VDR [rs2228570] [OR: 1.58; 95% CI: 1.05-2.36] in allelic models. The ACCA Haplotype of TaqI/ApaI/Bsml/FokI polymorphisms was associated with higher risk of SLE [OR = 2.28, 95% CI = 1.12-4.66, psim <.01]. Vitamin D deficiency was evidenced in 11.3% of the patients. Conclusion: In this study, the VDR rs2228570 polymorphism and ACCA haplotype were associated with higher SLE risk in an adolescent population.
Introducción: La vitamina D y los polimorfismos en el receptor de vitamina D (VDR) se asocian con enfermedades autoinmunes, incluido el lupus eritematoso sistémico (LES). El objetivo de este estudio es analizar la asociación genética entre los polimorfismos de VDR (Taql, Apal, Bsml y Fokl) y la susceptibilidad al LES, así como su relación con los niveles séricos de vitamina D en población del Caribe colombiano. Metodología: Estudio de casos y controles. Se incluyeron 133 pacientes adultos con diagnóstico de LES y 100 individuos sanos. Los polimorfismos VDR fueron genotipados por RT-PCR y sondas Taqman®. Se estimaron asociaciones alélicas, genotípicas y haplotípicas. Las concentraciones séricas de vitamina D fueron cuantificadas por Elisa. Se establecieron valores de 30 a 100ng/ml como rango normal de referencia. Valores p<0,05 fueron considerados estadísticamente significativos. Resultados: Se observó una alta prevalencia de LES en pacientes femeninas (94%) y se asoció a mayor riesgo de LES (OR: 10,8; IC95%: 4,7-24,6; p < 0,05). Se evidenció mayor riesgo de LES en individuos con polimorfismo Fokl del gen VDR [rs2228570] (OR: 1,58; IC95%: 1,05-2,36) en modelos alélicos. El haplotipo ACCA de los polimorfismos Taql, Apal, Bsml y Fokl se asoció a mayor riesgo de LES (OR: 2,28, IC95%: 1,12-4,66; psim<0,01). Se evidenció deficiencia de vitamina D en el 11,3% de los pacientes. Conclusión: En este estudio, el polimorfismo VDR rs2228570 y el haplotipo ACCA se asociaron a mayor riesgo de LES en población adolescente.
ABSTRACT
Introduction: Pediatric inflammatory multisystem syndrome temporally associated with SARS-CoV-2 (PIMS-TS) is a systemic hyperinflammatory disease that occurs in a small number of children after being infected with SARS-CoV-2. Macrophage activation syndrome, an aggressive condition characterized by the excessive inflammation and activation of well-differentiated macrophages, has been shown to occur in patients infected by SARS-CoV-2. Considering the clinical and pathophysiological similarities between these diseases, our main objective was to determine whether gene polymorphisms associated with macrophage activation syndrome were also present in patients with PIMS-TS. Methods: DNA from 10 pediatric patients with PIMS-TS (case group) and ten COVID-19 patients without PIMS-TS (control group) were genotyped by Real-time PCR analysis (TaqMan®) for single nucleotide polymorphisms (SNP) in four genes associated with macrophage activation syndrome: perforin 1 (PRF1), granzyme B (GZMB), syntaxin 11 (STX11), and syntaxin binding protein 2 (STXBP2). The SNP analysis was performed using the additive, dominant, and recessive models. Results: A significantly higher frequency of an SNP (C wild allele in rs6573910) in the GZMB gene was observed in both the additive and dominant models in the PIMS-TS group than controls. A borderline significant difference was also observed for the G allele in rs7764017 of the STX11 gene in the PIMS-TS group in the additive model. Conclusions: This study indicated the presence of two polymorphisms in genes associated with macrophage activation syndrome (GZMB and STX11) in patients who developed PIMS-TS. If the presence of these SNPs is validated in a larger number of PIMS-TS cases, they can be used as potential biomarkers for early identification of pediatric patients with a higher probability of developing PIMS-TS associated with SARS-CoV-2 infection.
Introdução: A síndrome multissistêmica inflamatória pediátrica temporariamente associada ao SARS-CoV-2 (SIMP-TS) é uma doença hiperinflamatória sistêmica que ocorre em um pequeno número de crianças após serem infectadas pelo SARS-CoV-2. A síndrome de ativação de macrófagos (SAM), uma condição agressiva caracterizada pela inflamação excessiva e ativação de macrófagos bem diferenciados, demonstrou ocorrer em pacientes infectados por SARS-CoV-2. Considerando as semelhanças clínicas e fisiopatológicas entre essas doenças, neste estudo o nosso principal objetivo foi determinar se polimorfismos gênicos associados à SAM também estavam presentes em pacientes com SIMP-TS. Métodos: DNA de dez pacientes pediátricos com SIMP (grupo caso) e dez pacientes COVID-19 sem SIMP (grupo controle) foram genotipados por análise de PCR em tempo real (tecnologia TaqMan®) para polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) em quatro genes selecionados associados com SAM: perforina 1 (PRF1), granzima B (GZMB), sintaxina 11 (STX11) e proteína de ligação de sintaxina 2 (STXBP2). A análise dos SNPs foi realizada utilizando o modelo aditivo, dominante e recessivo. Resultados: Uma frequência significativamente maior de um SNP (alelo selvagem C em rs6573910) no gene GZMB foi observada pelos modelos aditivo e dominante no grupo SIMP quando comparado aos controles. Além disso, uma significância limítrofe foi observada para o alelo G em rs7764017 do gene STX11 no grupo SIMP pelo modelo aditivo. Conclusões: Nosso estudo indicou a presença de dois polimorfismos em genes associados à SAM (GZMB e STX11) em pacientes que desenvolveram SIMP-TS. Uma vez validada a presença desses SNPs em um número maior de casos de SIMP-TS, eles podem ser usados como potenciais biomarcadores para a identificação precoce de pacientes pediátricos com maior probabilidade de desenvolver SIMP-TS associado à infecção por SARS-CoV-2.
Subject(s)
Humans , Child, Preschool , ChildABSTRACT
ABSTRACT Background: Recent studies show an increase in nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) in populations with higher consumption of red meat, processed and cooked at high temperatures. On the other hand, the single nucleotide polymorphism rs738409 in the Patatin-like phospholipase domain containing 3 (PNPLA3) gene has been implicated in susceptibility to NAFLD and liver fibrosis. However, the synergistic effect between red meat consumption and the PNPLA3 gene polymorphism in NAFLD has not yet been evaluated. Objective: To evaluate the association between the presence of the polymorphism in the PNPLA3 gene and the consumption of macronutrients, including meat consumption and its cooking method among NAFLD patients. Methods: This was a cross-sectional study with 91 patients diagnosed with NAFLD by liver biopsy with genotyping for the polymorphism in the PNPLA3 gene were included. The consumption of calories and macronutrients was verified using the semi-quantitative food frequency questionnaire and the specific questionnaire on meat consumption. PNPLA3 gene polymorphism was analyzed by real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) and anthropometric evaluation was realized. Results: The mean BMI was 32.38±4.58 kg/m² and the waist circumference was 107±10 cm. On liver biopsy, 42% of patients had significant fibrosis (F≥2). The odds ratio of F≥2 was 2.12 for the GG group and 1.54 for the CG group, compared to the CC group. The mean caloric intake was 1170±463.20 kcal/d. The odds ratio in the CC group concerning high red meat consumption in comparison to low consumption was 1.33. For white meat, the odds ratio was 0.8 when comparing high and low intake, also in the CC group. Conclusion: High red meat intake and PNPLA3 gene polymorphism seem to synergistically affect NAFLD and liver fibrosis, requiring confirmation in a larger number of patients and in different populations.
RESUMO Contexto: Estudos recentes mostram um aumento da doença hepática gordurosa não alcoólica (DHGNA) em populações com maior consumo de carne vermelha, processada e cozida em altas temperaturas. Por outro lado, o polimorfismo rs738409 no gene Patatin-like fosfolipase contendo 3 (PNPLA3) tem sido implicado na suscetibilidade à DHGNA e fibrose hepática. No entanto, o efeito sinérgico entre o consumo de carne vermelha e o polimorfismo no gene PNPLA3 na DHGNA ainda não foi avaliado. Objetivo: Avaliar a associação entre a presença do polimorfismo no gene PNPLA3 e o consumo de macronutrientes, incluindo o consumo de carne e seu modo de cozimento em pacientes com DHGNA. Métodos: Realizamos um estudo transversal com 91 pacientes diagnosticados com DHGNA por biópsia hepática e genotipados para o polimorfismo no gene PNPLA3. O consumo de calorias e macronutrientes foi verificado por meio do questionário de frequência alimentar semi-quantitativo (QFA) e do questionário específico sobre consumo de carnes. O polimorfismo no gene PNPLA3 foi analisado por reação em cadeia da polimerase em tempo real (RT-PCR) e a avaliação antropométrica foi realizada. Resultados: O índice de massa corporal médio foi de 32,38±4,58 kg/m² e a circunferência da cintura foi de 107±10 cm. Na biópsia hepática, 42% dos pacientes apresentavam fibrose significativa (F≥2). O odds ratio de F≥2 foi de 2,12 para o grupo GG e 1,54 para o grupo GC, comparado ao grupo CC. A ingestão calórica média foi de 1.170±463,20 kcal/d. O odds ratio para alto consumo de carne vermelha no grupo CC em comparação ao baixo consumo foi de 1,33. Para a carne branca, este valor foi de 0,8 ao comparar o alto e o baixo consumo, também no grupo CC. Conclusão: A alta ingestão de carne vermelha e o polimorfismo no gene PNPLA3 parecem afetar sinergicamente a DHGNA e a fibrose hepática, necessitando de confirmação em maior número de pacientes e em diferentes populações.
ABSTRACT
ABSTRACT BACKGROUND AND OBJECTIVES: Cannabis is the most popular and consumed illicit drug in the world, it has about 540 bioactive phytocannabinoids, including tetrahydrocarbinol (THC) and cannabidiol (CBD). The therapeutic potential of phytocannabinoids has been the subject of many studies in recent decades for many medical situations, including the management of chronic pain. The advent of pharmacogenetics currently allows the indication of the Cannabis dose to be evaluated individually. The objective of this work was to carry out a survey of the literature on the medicinal use of Cannabis and the application of pharmacogenetics in this therapy. CONTENTS: THC and CBD phytocannabinoids are the most abundant and researched. In the endocannabinoid system there are compounds similar to phytocannabinoids, cell receptors and metabolism enzymes. All these molecules are secreted from genes, which may have individual genetic polymorphisms that determine the modulation of the endocannabinoid system, and consequently impact the patients' therapeutic response. CONCLUSION: The existence of genetic tests for the prior assessment of the patients genetic profile in order to avoid side effects and to have more assertiveness in the indication of the cannabis product is an important tool to increase adherence to cannabis treatment.
RESUMO JUSTIFICATIVA E OBJETIVOS: A cannabis é a droga ilícita mais popular e consumida no mundo, possuindo cerca de 540 fitocanabinoides bioativos, entre eles o tetra-hidrocarbinol (THC) e o canabidiol (CBD). O potencial terapêutico dos fitocanabinoides tem sido alvo de muitos estudos nas últimas décadas para muitas situações médicas, incluindo o manejo da dor crônica. O advento da farmacogenética permite que atualmente a indicação da dose de cannabis seja avaliada individualmente. O objetivo deste estudo foi realizar um levantamento da literatura sobre o uso medicinal da cannabis e a aplicação da farmacogenética nessa terapia. CONTEÚDO: Os fitocanabinoides THC e CBD são os mais abundantes e pesquisados. No sistema endocanabinoide, existem compostos similares aos fitocanabinoides, receptores celulares e enzimas de metabolismo. Todas essas moléculas são secretadas a partir de genes que podem possuir polimorfismos genéticos individuais determinantes para a modulação do sistema endocanabinoide e, consequentemente, impactam a resposta terapêutica do paciente. CONCLUSÃO: A existência de testes genéticos para avaliação prévia do perfil genético do paciente a fim de evitar efeitos colaterais e ter mais assertividade na indicação do produto de cannabis é uma importante ferramenta para aumentar a aderência ao tratamento com cannabis.
ABSTRACT
Resumen OBJETIVO: Determinar la frecuencia del alelo Ala en una muestra de mujeres mexicanas con diabetes mellitus gestacional y asociar su repercusión en la glucemia. MATERIALES Y MÉTODOS: Estudio ambispectivo, observacional, transversal y correlacional efectuado en una cohorte de pacientes con diabetes gestacional atendidas entre los meses de enero a junio del 2014 en el Hospital Militar de Especialidades de la Mujer y Neonatología de la Secretaría de la Defensa Nacional en la Ciudad de México. Se evaluó el polimorfismo mediante amplificación de un fragmento de ADN mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y su secuenciación. RESULTADOS: Se estudiaron 81 pacientes; 3 de ellas con el alelo Ala, con concentraciones de glucosa menores y antecedente de más abortos en comparación con las mujeres sin el alelo Ala. CONCLUSIONES: La coexistencia del alelo Ala en mujeres embarazadas con diagnóstico de diabetes mellitus gestacional pudiera tener un efecto protector en contra de la hiperglucemia en el embarazo y el riesgo de aborto.
Abstract OBJECTIVE: To determine the frequency of peroxisomal proliferator-activated receptor gamma (PPARg) polymorphism of proline substituted with an alanine in amino acid 12 (Pro12Ala), in women with gestational diabetes mellitus and associate its impact with glycemia. MATERIALS AND METHODS: An ambispective, observational, cross-sectional and correlational study was carried out in a cohort of women with gestational diabetes that included 81 pregnant women treated at the Military Hospital for Women's Specialties and Neonatology of the Ministry of National Defense in the city from Mexico. Polymorphism was evaluated by amplification of a DNA fragment by PCR Polymerase Chain Reaction and its sequencing. RESULTS: The results indicated that 13.5% of the women carriers of the Ala allele also had lower blood glucose values and a history with a higher number of abortions compared to women without the Ala allele. CONCLUSIONS: The presence of the Ala allele in pregnant women with gestational diabetes mellitus could have a protective effect against hyperglycemia in pregnancy and a risk of abortion.
ABSTRACT
ABSTRACT Objective: To determine whether polymorphisms of the IL10 and IL17 genes are associated with severe asthma control and bronchodilator reversibility in children and adolescents with severe asthma. Methods: This was a cross-sectional study, nested within a prospective cohort study of patients with severe asthma. Two outcomes were evaluated: asthma control and bronchodilator reversibility. We extracted DNA from peripheral blood and genotyped three single nucleotide polymorphisms: rs3819024 and rs2275913 in the IL17A gene; and rs3024498 in the IL10 gene. For the association analyses, we performed logistic regression in three genetic models (allelic, additive, and dominant). Results: The rs3024498 C allele in the IL10 gene was associated with failure to achieve asthma control despite regular treatment (p = 0.02). However, the G allele of the IL17A rs3819024 polymorphism was associated with failure to respond to stimulation with a b2 agonist. The rs2275913 polymorphism of the IL17A gene showed no relationship with asthma control or bronchodilator reversibility. Conclusions: In pediatric patients with severe asthma, the IL10 polymorphism appears to be associated with failure to achieve clinical control, whereas the IL17A polymorphism appears to be associated with a worse bronchodilator response. Knowledge of the involvement of these polymorphisms opens future directions for pharmacogenetic studies and for the implementation of individualized therapeutic management of severe asthma in pediatric patients.
RESUMO Objetivo: Determinar se existe relação entre polimorfismos dos genes IL10 e IL17 e controle da asma grave e reversibilidade com broncodilatador em crianças e adolescentes com asma grave. Métodos: Estudo transversal, aninhado em um estudo prospectivo de coorte com pacientes com asma grave. Foram avaliados dois desfechos: controle da asma e reversibilidade com broncodilatador. Extraímos DNA do sangue periférico e genotipamos três polimorfismos de nucleotídeo único: rs3819024 e rs2275913 no gene IL17A e rs3024498 no gene IL10. Para as análises de associação, realizamos regressão logística em três modelos genéticos (alélico, aditivo e dominante). Resultados: O alelo C do polimorfismo rs3024498 do gene IL10 apresentou relação com asma que permaneceu descontrolada mesmo com tratamento regular (p = 0,02). No entanto, o alelo G do polimorfismo rs3819024 do gene IL17A apresentou relação com ausência de resposta ao estímulo com b2-agonista. O polimorfismo rs2275913 do gene IL17A não apresentou relação com controle da asma ou reversibilidade com broncodilatador. Conclusões: Em pacientes pediátricos com asma grave, o polimorfismo do gene IL10 parece estar relacionado com ausência de controle clínico, ao passo que o polimorfismo do gene IL17A parece estar relacionado com pior resposta ao broncodilatador. O conhecimento a respeito do envolvimento desses polimorfismos abre perspectivas futuras para estudos farmacogenéticos e para a implantação de manejo terapêutico individualizado da asma grave em pacientes pediátricos.
ABSTRACT
Objetivo:Elucidar o quadro clínico do transtorno depressivo maior (TDM) e verificar a associação dessa condição com polimorfismos do gene IL6. Método:Tratou-se de uma revisão sistemática com a busca de artigos originais nas bases de dados Scopus, Web of Science, PubMed e BVS, os quais trouxeram informações sobre variantes genéticas que tinham relação com polimorfismos do gene IL6. Estudos que não apresentaram dados completos, inclusive dados estatísticos, revisões, meta-análises e resumos, foram excluídos. Resultados:Foram encontrados 54 artigos nas bases de dados. Utilizou-se a plataforma Rayyan para retirar as duplicatas e ler os resumos para seleçãoinicial. Restaram 12 artigos, onde os que eram de acesso livre foram encaminhados para leitura completa, totalizando 5 artigos para essa revisão. Conclusão:Evidências sugerem uma condição sistêmica no TDM e dados demonstram alterações inflamatórias. Dadoque na maior parte dos estudos pacientes com TDM tiveram estados inflamatórios mais elevados, parece haver relação entre a IL-6 e o transtorno. A IL-6 induz alterações no cérebro, ativação de microglia e controla a saúde dos neurônios, podendo tornar tangível uma relação dos polimorfismos com a doença, mas ainda não existem muitos estudos na área
Objective:To elucidate the clinical picture of major depressive disorder (MDD) and to verify the association of this condition with polymorphisms of the IL6 gene. Method:This was a systematic review with the search of original articles in the databases Scopus, Web of Science, PubMed and VHL, which brought information about genetic variants that were related to polymorphisms of the IL6 gene. Studies that did not present complete data, including statistical data, reviews, meta-analyses and abstracts, were excluded. Results:A total of 54 articles were found in the databases. The Rayyan platform was used to remove the duplicates and read the abstracts for initial selection. There were 12 articles, where those that were freely accessible were sent for full reading, totaling 5 articles for this review. Conclusion:Evidence suggests a systemic condition in MDD and data demonstrate inflammatory changes. Given that in most studies patients with MDD had higher inflammatory states, there seems to be a relationship between IL-6 and the disorder. IL-6 induces changes in the brain, activation of microglia and controls the health of neurons, and may make tangible a relationship between polymorphisms and the disease, but there are not many studies in the area.
Objetivo: Dilucidar el cuadro clínico del trastorno depresivo mayor (TDM) y verificar la asociación de esta condición con polimorfismos del gen IL6. Método: Se trata de una revisión sistemática con búsqueda de artículos originales en las bases de datos Scopus, Web of Science, PubMed y BVS, que aportaron información sobre variantes genéticas relacionadas con polimorfismos del gen IL6. Se excluyeron los estudios que no presentaron datos completos, incluidos datos estadísticos, revisiones, metanálisis y resúmenes. Resultados:Se encontraron un total de 54 artículos en las bases de datos. La plataforma Rayyan se utilizó para eliminar los duplicados y leer los resúmenes para la selección inicial. Hubo 12 artículos, donde aquellos que eran de libre acceso fueron enviados para lectura completa, totalizando 5 artículos para esta revisión. Conclusión:La evidencia sugiere una condición sistémica en el TDM y los datos demuestran cambios inflamatorios. Dado que en la mayoría de los estudios los pacientes con TDM tenían estados inflamatorios más altos, parece haber una relación entre la IL-6 y el trastorno. La IL-6 induce cambios en el cerebro, la activación de la microglía y controla la salud de las neuronas, y puede hacer tangible una relación entre los polimorfismos y la enfermedad, pero no hay muchos estudios en el área.
Subject(s)
Polymorphism, Genetic , Receptors, Interleukin-6 , Depressive Disorder, MajorABSTRACT
Objetivo:Revisar e discorrer sobre os estudos científicos que buscam a associação do polimorfismo do gene MAOA, do tipo uVNTR, com distúrbios mentais em adultos. Método:Foi realizada uma revisão integrativa de acordo com o modelo PRISMA. A pesquisa seguiu as etapas de formulação da questão de pesquisa, seleção das bases de dados de busca de referências, definição da estratégia de busca, avaliação da elegibilidade dos estudos, triagem e seleção dos artigos, extração de dados e compilação dos resultados. Resultados:Foram selecionados 12 artigos originais que relataram o polimorfismo do tipo u-VNTR e seus alelos de 2, 3, 3,5, 4 e 5 repetições no gene MAOA, e sua associação com distúrbios psíquicos. Conclusão:O polimorfismo do gene MAOA do tipo uVNTR está relacionado com a funcionalidade da enzima MAOA, aumentando ou diminuindo sua atividade, elevando ou diminuindo os níveis de dopamina, serotonina ou noradrenalina, e essas alterações estão relacionados à diversos distúrbios mentais, como esquizofrenia, depressão, comportamentos agressivos antissociais, ansiedade, transtorno de déficit de atenção e hiperatividade (TDAH), transtorno do espectro autista e outros distúrbios relacionados à expressão desses neurotransmissores.
Objective: To review and discuss scientific studies that seek the association of the polymorphism of the MAOA gene, of the uVNTR type, with mental disorders in adults. Method: An integrative review was performed according to the PRISMA model. The research followed the stages of formulation of the research question, selection of reference search databases, definition of the search strategy, evaluation of the eligibility of studies, screening and selection of articles, data extraction and compilation of results. Results:We selected 12 original articles that reported the u-VNTR polymorphism and its alleles of 2, 3, 3.5, 4 and 5 repeats in the MAOA gene, and its association with psychic disorders. Conclusion: The polymorphism of the MAOA gene of the uVNTR type is related to the functionality of the MAOA enzyme, increasing or decreasing its activity, raising or decreasing the levels of dopamine, serotonin or noradrenaline, and these changes are related to several mental disorders, such as schizophrenia, depression, aggressive antisocial behaviors, anxiety, attention deficit hyperactivity disorder (ADHD), autism spectrum disorder and other disorders related to the expression of these neurotransmitters.
Objetivo: Revisar y discutir estudios científicos que busquen la asociación del polimorfismo del gen MAOA, del tipo uVNTR, con trastornos mentales en adultos. Método:Se realizó una revisión integradora según el modelo PRISMA. La investigación siguió las etapas de formulación de la pregunta de investigación, selección de bases de datos de búsqueda de referencias, definición de la estrategia de búsqueda, evaluación de la elegibilidad de los estudios, selección y selección de artículos, extracción de datos y compilación de resultados. Resultados:Se seleccionaron 12 artículos originales que reportaron el polimorfismo u-VNTR y sus alelos de 2, 3, 3.5, 4 y 5 repeticiones en el gen MAOA, y su asociación con trastornos psíquicos. Conclusión:El polimorfismo del gen MAOA del tipo uVNTR está relacionado con la funcionalidad de la enzima MAOA, aumentando o disminuyendo su actividad, elevando o disminuyendo los niveles de dopamina, serotonina o noradrenalina, y estos cambios están relacionados con varios trastornos mentales, como esquizofrenia, depresión, conductas antisociales agresivas, ansiedad, trastorno por déficit de atención con hiperactividad (TDAH), trastorno del espectro autista y otros trastornos relacionados con la expresión de estos neurotransmisores.
Subject(s)
Polymorphism, Genetic , Central Nervous System DiseasesABSTRACT
Introducción: los cambios en el ácido desoxirribonucleico se conocen como mutaciones, estas dan lugar a los polimorfismos, los cuales generan variación alélica entre individuos y diversidad de la misma especie. Se ha sugerido que los polimorfismos genéticos en los mediadores inmunitarios desempeñan un papel fundamental en la patogénesis de muchos trastornos autoinmunes, como en la púrpura trombocitopénica inmune, siendo esta el tipo más común de púrpura trombocitopénica y, a menudo, se diagnostica como un tipo de trastorno autoinmune, debido a la destrucción de las plaquetas mediadas por el sistema inmunitario. Objetivo: realizar una revisión bibliográfica sobre el papel de los polimorfismos genéticos y su influencia en el desarrollo de la púrpura trombocitopénica inmune. Métodos: se realizó revisión literaria en inglés y español en PubMed y Elsevier, desde marzo hasta mayo del 2021, con el uso de combinación de palabras clave y términos MeSH, como púrpura trombocitopénica y polimorfismos genéticos. Se realizó análisis y resumen de la literatura encontrada. Conclusión: la púrpura trombocitopénica inmune es considerada como una patología multifactorial, causada por factores ambientales y genéticos, dentro de los cuales se encuentran los polimorfismos para los mediadores inmunitarios que pueden llevar a una exacerbación de la enfermedad o no intervenir en la misma.
Introduction: Changes in deoxyribonucleic acid are known as mutations, these give place to polymorphisms, which generate allelic variation between individuals and provide diversity among same species. Genetic polymorphisms in immune mediators have been suggested to play a key role in the pathogenesis of many autoimmune disorders, such as immune thrombocytopenic purpura, this being the most common type of thrombocytopenic purpura and is often diagnosed as a type of autoimmune disorder, due to the destruction of platelets mediated by the immune system. Objective: To execute a bibliographic review on the role of genetic polymorphisms and their influence on the development of immune thrombocytopenic purpura. Methods: A literary review in English and Spanish was performed in PubMed and Elsevier from March to May 2021, with the use of a combination of keywords and MeSH terms such as Thrombocytopenic Purpura and genetic polymorphisms. Analysis and summary of the literature found was executed. Conclusion: Immune thrombocytopenic purpura is considered a multifactorial pathology, caused by environmental and genetic factors, among which are polymorphisms for immune mediators that can lead to an exacerbation of the disease or not intervene in the same.
Subject(s)
Polymorphism, Genetic , Purpura, Thrombocytopenic , Blood Platelets , Risk Factors , Hematologic DiseasesABSTRACT
To conduct ex-situ creole pig conservation programs, it is essential to determine which breeding animals will be used, preferentially those with a more significant Iberian genetic component to preserve their origin. This study used a Yucatan black hairless pigs (YBHP) subpopulation to estimate its genetic diversity and population structure. One hundred four adult pigs were selected for the absence of hair, black skin (without spots), black hoof, and straight snout. The porcine-GGP-50K chip was used for SNP genotyping in YBHP, and information on Iberian and Yucatán hairless pigs from the United States (USYU) was taken from databases. All analysis was performed using PLINK v1.9 and v2.1 software. Inbreeding and fixation index values were lower in YBHP, with high observed heterozygosity and allogamy index values, which agree with those obtained in the populations of Canarias and Chato Murciano. According to the clusters generated by the "Genome-Wide Identity by State" analysis, four groups were identified, one of which included pigs from Guadyerbas, USYU, and YBHP. Between populations, YBHP was closely related to the hairless pigs from Guadyerbas, USYU, and Canarias. Principal component analysis showed the same result. According to the results obtained from the runs of homozygosity investigation, aimed to get pools consensus of regions of overlapping, 119 SNPs associated with genes and biological processes were identified. The BMP7 and NSUN2 genes were associated with epithelial cell differentiation, morphogenesis, and epithelial development. For nutrient metabolism: energy, the HADHA, PPARA, ADD1/SREBF1, and FAT 1genes were identified.(AU)
Para realizar programas de conservação ex-situ de suínos crioulos, é importante determinar quais animais serão criados, preferencialmente aqueles com maior componente de genética ibérica, para preservar sua origem. Uma subpopulação de porco preto calvo de Yucatán (YBHP) foi usada para estimar sua diversidade genética e estrutura populacional. Um total de 104 suínos adultos foram selecionados levando-se em consideração características como ausência de pelos, pele preta (sem manchas), casco preto e focinho reto. O painel GGP-50K foi utilizado para a genotipagem dos SNPs em animais YBHP, e informações de porcos sem pelos ibéricos e de Yucatán dos Estados Unidos (USYU) foram retiradas de bancos de dados. Todas as análises foram realizadas com o software PLINK v1.9 e v2.1. Os valores dos índices de endogamia e fixação foram menores em YBHP, com altos valores de índice de heterozigosidade e alogamia observados, que concordam com os obtidos nas populações de Canárias e Chato Murciano. De acordo com os clusters gerados pela análise "Genoma-Wide Identity By State", quatro grupos foram identificados, um dos quais incluiu porcos de Guadyerbas, USYU e YBHP. Entre as populações, YBHP estava intimamente relacionado com os porcos sem pelo de Guadyerbas, USYU e Canárias. A análise de componentes principais mostrou o mesmo resultado. De acordo com os resultados obtidos nas corridas de investigação de homozigose, visando obter consenso de pools de regiões de sobreposição, foram identificados 119 SNPs associados a genes e processos biológicos. Os genes BMP7 e NSUN2 foram associados à diferenciação de células epiteliais, morfogênese e desenvolvimento epitelial. Para metabolismo de nutrientes: energia, os genes HADHA, PPARA, ADD1/SREBF1 e FAT1 foram identificados.(AU)
Subject(s)
Animals , Swine/genetics , Genetic Variation , Polymorphism, Single Nucleotide , MexicoABSTRACT
Abstract Allium sativum L. is an herb of the Alliaceae family with a specific taste and aroma and medicinal and nutraceutical properties that are widely marketed in several countries. Brazil is one of the largest importers of garlic in the world, despite of its production is restricted and limited to internal consumption. Thus, explore the genetic diversity of commercial garlic conserved at germplasm banks is essential to generate additional genetic information about its economically important crop. A suitable tool for this purpose is the cytogenetic characterisation of these accessions. This study aimed to characterise the cytogenetic diversity among seven accessions of garlic from a Germplasm Bank in Brazil. The karyotypes were obtained by conventional staining and with chromomycin A3 (CMA) and 4,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) fluorochromes. All accessions analysed showed chromosome number 2n = 16, karyotype formula 6M+2SM, symmetrical karyotypes, reticulate interphase nuclei, and chromosomes with uniform chromatin condensation from prophase to metaphase. The fluorochromes staining showed differences in the amount and distribution of heterochromatin along the chromosomes and between accessions studied. Based on the distribution pattern of these small polymorphisms, it was possible to separate the seven accessions into three groups. It was also possible to differentiate some of the accessions individually. One of the results obtained showed a heteromorphic distension of the nucleolar organiser region observed on the chromosome pairs 6 or 7 with peculiar characteristics. It was suggested for example, that the heteromorphic block of heterochromatin (CMA+++/DAPI-) on chromosome 6 of the "Branco Mineiro Piauí" accession can be used as a marker to identify this genotype or may be associated with some character of economic interest.
Resumo Allium sativum L. é uma erva da família Alliaceae com sabor e aroma específicos e propriedades medicinais e nutracêuticas amplamente comercializada em diversos países. O Brasil é um dos maiores importadores de alho do mundo, apesar da sua produção ser restrita e limitada ao consumo interno. Assim, explorar a diversidade genética do alho comercial conservado em bancos de germoplasma é essencial para fornecer informações genéticas adicionais acerca dessa cultura economicamente importante. Uma ferramenta adequada para esse fim é a caracterização citogenética desses acessos. Este estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade citogenética entre sete acessos de alho de um Banco de Germoplasma no Brasil. Os cariótipos foram obtidos por coloração convencional e com os fluorocromos de cromomicina A3 (CMA) e 4,6-diamidino-2-fenilindol (DAPI). Todos os acessos analisados apresentaram número cromossômico 2n = 16, fórmula cariotípica 6M + 2SM, cariótipos simétricos, núcleos reticulados em intérfase e cromossomos com condensação uniforme da cromatina da prófase para a metáfase. A coloração com fluorocromos mostrou diferenças na quantidade e distribuição de heterocromatina ao longo dos cromossomos e entre os acessos estudados. Com base no padrão de distribuição desses pequenos polimorfismos, foi possível separar os sete acessos em três grupos. Também foi possível diferenciar individualmente alguns dos acessos. Um dos resultados obtidos mostrou distensão heteromórfica da região organizadora nucleolar observada nos pares dos cromossomos 6 ou 7 com características peculiares. Foi sugerido, por exemplo, que o bloco heteromórfico de heterocromatina (CMA +++ / DAPI-) no cromossomo 6 do acesso "Branco Mineiro Piauí" pode ser usado como um marcador para identificar esse genótipo ou pode estar associado a algum caráter de interesse econômico.